Situada dins del nucli antic de Sant Martí d’Empúries, al bell mig de la plaça Major, i edificada damunt les restes del fossat del castell medieval. És un edifici gòtic tardà començat l’any 1507 (tal com indica una de les làpides de la façana) i es va concloure cap al 1538. Anteriorment hi havia hagut una església romànica, però no se sap segur si era en aquest mateix lloc. Consta d’una sola nau, a la façana hi ha una rosassa, i una portada d’arc ogival, amb l’ornamentació molt desgastada. Damunt la porta hi ha les làpides commemoratives, la del segle X, la del XIII i la del XVI, corresponents a les diverses obres fetes a l’església antiga i a la nova. Entre els carreus del parament hi ha nombrosos fragments de terrissa grecoromana. A l’interior destaquen les claus de volta, diverses ares paleocristianes i una pica baptismal romànica.
